Nature:首次报告世界上迄今为止最大规模的人类全基因组测序工作

发布时间:2022-07-22阅读量:222

在一项新的研究中,来自deCODE Genetics和冰岛雷克雅未克大学等研究机构的研究人员报告了英国生物库(UK biobank)中15万参与者的全基因组序列。这是迄今为止最大的全基因组测序工作,这些作者将在三年内对50万个全基因组进行测序。相关研究结果于2022年7月20日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“The sequences of 150,119 genomes in the UK Biobank”。

这些作者在这15万个基因组中发现了6亿个单核苷酸多态性(SNP)和序列插入/缺失(indel),相当于人类基因组中理论上可能出现的那些SNP和indel的7%。然而,理论上可能出现的一些变体很可能与生命不相容。

这个庞大的数据集使这些作者能够将那些能够容忍序列中巨大多样性的区域与那些不能容忍巨大多样性的区域分开。人们假设不耐受序列多样性的区域对人类的生存和生育很重要。长期以来,人们一直认为编码外显子(coding exon)是对人类生存最重要的区域。然而,当对基因组中序列保守性最好的1%进行研究时,其中只有13%是编码外显子。

deCODE Genetics创始人、论文共同通讯作者Kari Stefansson说,“这种类型和数量的数据将彻底改变我们识别和表征对人类多样性具有重要意义的基因间序列的能力,无论是对疾病风险和治疗反应还是其他一些特性。”

英国生物库中序列变异的突变类型。图片来自Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-04965-x。

此外,这些作者还报告了那些没有通过全外显子组测序确定的变体与疾病和其他表型之间的关联性。

英国生物库的参与者具有不同的遗传血统,他们的祖先来自世界上的大多数国家。这些作者确定,85%的参与者可以将他们的大部分祖先追溯到不列颠群岛。他们还发现有一大群参与者可以将他们的祖先大部分追溯到非洲和南亚。这项新的研究可能代表了最大的一组非洲和南亚血统的全基因组测序个体。然而,从社会和科学的角度来看,为这项新的研究以及其他已经发表的研究提供序列的人的种族比例失衡是令人遗憾的。这些作者决心在未来努力实现更为种族平衡的测序队列。




来源 | 健康界

版权归原作者所有,若有违规、侵权请联系我们

160
222
我有话说:
0 / 5000
所有评论(1条)
最新最热
非晚
这些作者决心在未来努力实现更为种族平衡的测序队列。
评论时间:2022-07-22
回复
0
  • 1
前往
关注我们
精英荟医生招聘
官方公众号
精英荟医生招聘
官方小程序
资讯动态
MORE+
1
173家医院升为三级!揭秘医院等级评审重点与痛点
2
苗建亭教授:老年性痴呆症的预防和治疗
3
李x教授,谁不想全民免费医疗?
4
《关于促进数字中医药发展的若干意见》政策解读
5
孩子注意力不集中的5个原因
6
全球超170个新药研发加速,突破性疗法助力乙肝治愈
7
准爸妈须知!出现这些情况不易备孕!兰州天伦生殖不孕症医院科普
8
儿童感统失调表现及科室就诊指南
9
秋意渐浓,警惕‘秋老虎’对心脏的潜在威胁
10
关于做好2024年中国医师节有关工作的通知
11
公立医院再次被要求「过紧日子」,仍需探索下一步怎么走?
12
糖尿病、脂肪肝比肝炎、肝硬化更易罹肝癌?
13
公立医院再次被要求「过紧日子」,仍需探索下一步怎么走?
14
【老年心理】高龄老人的嗅觉、味觉、温度觉、触觉
15
政策红利叠加需求激增,“康养+疗愈”模式成银发文旅新风口